苗木吸收的水分主要来源于雨水、地下水及灌溉水。在干旱地区要依靠灌水补充土壤中的水分。
但如果雨水过多或排水不畅，也会影响苗木的呼吸，严重的会导致烂根甚至死亡。

首先对于苗木不同栽培方式要选择不同的浇水方法。

播种苗在播种后要通过合理的灌溉使苗床保持湿润，一般要求灌水次数要多，每次灌水量要少。

扦插、压条苗在生根、发芽时需水量较大，特别是刚开始展叶而未完全生根阶段，土壤水分供应量少，一旦断水就造成植株死亡。
浇水时要注意水流要细缓，以免水流冲力移动苗木，在干燥时要适当加大灌水量。

分株、移植苗由于在栽植时根系受伤，苗木内部水分供应部平衡，必须要加强供水。
在苗木分株、移植后要连续浇水3-4次，灌水量要大，每次浇水间隔时间不能太长。

嫁接苗对水分需求不是太大，只要能保证砧木正常生长即可，水不能太多。
在干旱浇水时应注意，接口部位不能积水，否则会使伤口腐烂。

对正常生长中的苗木浇水要灵活掌握，在苗木生长旺季可适当增加浇水次数。
黏性土壤保水力较强，浇水量要适当减少，沙性土壤保水力较差可适当增加浇水量。
同时要注意苗木耐旱能力，一般树种土壤保持湿润状态即可，根据实际情况确定浇水量。
水多时要做好排水工作，苗圃地不应有积水，否则会降低土壤有机质的分解速度，破坏苗木根系的正常呼吸，常引起根系腐烂甚至死亡。
此外在秋季为了使苗木组织充实和木质化，一般不浇水。
北方要在土壤结冻以前叫一次冻水，利于苗木安全越冬。