很多苗圃都选用套种增加苗圃圃地利用率，增产增收，但是套种苗木管理起来却有一定难度。
首先在种植前要选好树种，切不可盲目种植，影响苗木生长及质量。
苗圃套种种植后可参考一下几点进行管理：

一、水肥管理
在日常浇水中灌木根系相对较浅，抗旱能力较弱，所以浇水次数要多一点。
而乔木根系较深，抗旱能力较强，一般可靠自然降水生长。
很多人在给灌木浇水的时候顺便给乔木浇水，这样做对两者和谐共处十分不利。
并且容易使乔木根系散漫在浅土层中，对抗旱及抗风性不利。
两者对水分要求相同的地方可结合在一起浇水，如封冻水和返青水。
此外灌木对肥料的要求比乔木要更高一些，特别是花灌木，充足的肥料是决定其开花质量的关键。
对于生长多年的乔木一般在秋末施肥即可，而灌木则要在春季、夏季、秋季各施一次。
因此施肥时要注意，再给乔木施肥时要深施，给花灌木施肥时要浅施，这样更利于苗木吸收和生长。

二、苗木修剪
对苗木修剪主要目的是要利于苗木健康生长，其次才是提高苗木观赏性。
对乔木修剪要注意及时将病虫枝剪除，防止病虫对灌木造成侵害。
对干枯枝要及时进行清理，避免干枯枝掉落砸坏花灌木。
此外要对乔木冗杂枝进行疏剪，加强树冠通风透光，使灌木接受更多的光照，利于灌木生长。
对灌木修剪首先要提高通风透光性，使苗木健康生长，其次按照灌木习性进行合理修剪。

三、病虫害防治
若乔木与灌木同时患一种病虫害，可采取同一种措施进行防治。
若只有乔木或灌木患病虫害，则要考虑所使用药物是否会影响另一个树种生长。